A、∵±3的平方是9,∴9的平方根是±3,故选项错误;
B、∵-5的平方是25,∴25的负的平方根是-5,故选项正确;
C、∵任何数的平方不一定正数,其中0的平方就是0,故选项错误;
D、由于负数没有平方根,故选项错误.
故选B.