解题思路：生物变异包括可遗传变异和不可遗传变异，其中可遗传变异包括：基因突变、基因重组和染色体变异，而不可遗传变异是由环境因素导致的，其遗传物质并没有改变．
先天性疾病是在胎儿期得的，也就是胎儿在子宫内的生长发育过程中，受到外界或内在不良因素作用，致使胎儿发育不正常，出生时已经有表现或有迹象的疾病．如：风疹病毒感染引起的畸形、先天性髋关节脱位等．
遗传病是指父母亲的精子或卵子发育异常，而导致胎儿发生器质性或功能性的不正常．这种病可以出生后就表现出来，也可以生后长到一定年龄时才表现出来．如：精神病是可以遗传的，多数到青春期才开始发病．
A、不可遗传变异是由环境因素导致的生物性状的变化，其遗传物质并没有改变，A错误；
B、原核生物的遗传信息的传递过程遵循中心法则，但不遵循分离定律，分离定律只适用于真核生物的有性生殖，B错误；
C、由于同源染色体上的基因可能是等位基因，因此一个精原细胞通过减数分裂最终形成4个并且是两种精子，即由一个精原细胞产生的两个精子中的遗传物质可能不同，C正确；
D、先天性疾病不一定都是遗传病，如麻疹、风疹病毒感染引起的畸形等，D错误．
故选：C．
点评：
本题考点： 细胞的减数分裂．
考点点评： 本题考查了生物变异、遗传定律的适用范围、遗传病等方面的知识，意在考查考生的识记能力和区分理解能力，难度适中．考生要明确先天性疾病不一定都是遗传病，遗传病并不一定都是先天性疾病；并且遗传定律只适用于真核生物的有性生殖．