解题思路：双名法又称二名法，是林奈提出的，以拉丁文表示，通常以斜体字或下划双线以示区别．第一个是属名，是主格单数的名词，第一个字母大写；后一个是种名，常为形容词，须在词性上与属名相符．
生物分类单位由大到小是界、门、纲、目、科、属、种．界是最大的分类单位，最基本的分类单位是种．分类单位越大，共同特征就越少，包含的生物种类就越多；分类单位越小，共同特征就越多，包含的生物种类就越少．
A、扬子鳄与长吻鳄不同种也不同属，A错误；
B、非洲鳄与密河短吻鳄不同属也不同种，B错误；
C、非洲鳄与长吻鳄不同属也不同种，亲缘关系较远，C错误；
D、扬子鳄与密河短吻鳄同属不同种，亲缘关系最近，D正确．
故选：D
点评：
本题考点： 生物进化的历程．
考点点评： 解答此类题目的关键是熟记生物的分类单位等级及双名法．