解题思路：男生比全班人数的[5/9]少4人，即女生人数为全班的1-[5/9]=[4/9]多4人，又女生比全班人数的40%多6人，则6-2人占全班人数的[4/9]-40%，则全班人数为（6-4）÷（[4/9]-40%）人，进而求得该班男生比女生少多少人．
全班：（6-4）÷（1-[5/9]-40%）
=2÷[2/45]，
=45（人）；
男生有：
45×[5/9]-4=25-4=21（人）；
男生比女生少：
45-21-21=3（人）；
答：该班男生比女生少3人．
故选：B．
点评：
本题考点： 分数、百分数复合应用题．
考点点评： 由题意明确女生人数为全班的1-[5/9]=[4/9]多4人是完成本题的关键．