（1）1号种子所处的环境中缺水水分，因此不能萌发；2号种子具备了种子萌发的外界条件即：适量的水分、充足的空气、适宜的温度．因此，种子能萌发；3号种子浸没在水中，缺少空气，因此不能萌发．4号种子所处的环境温度太低且缺水水分，因此种子不能萌发；5号种子所处的环境温度太低，即没有适宜的温度，因此种子不能萌发；6号种子浸没在水中，缺少空气，且所处的环境温度太低，因此种子不能萌发．
（2）1号和2号种子唯一的变量是水分，因此1号和2号种子对比，说明种子萌发需要 一定的水分；3号与2号种子唯一的变量是空气，因此3号与2号种子对比，说明种子萌发需要 充足的空气；5号与2号种子唯一的变量是温度，因此5号与2号种子对比，说明种子萌发需要 适宜的温度；因此这个实验说明种子萌发所需的外界条件是适宜的温度、一定的水分、充足的空气．
（3）种子萌发必须同时具备外界条件和自身条件．种子萌发的外界条件具备了，没有萌发的原因应该是种子的自身的条件不适宜，如胚不完整、胚不是活的等．
（4）对照实验：指在研究一种条件对研究对象的影响时，所进行的除了这种条件不同之外，其他条件都相同的实验．其中不同的条件就是实验变量；设计原则：一个探究实验中只能有一个实验变量，其他因素均处于相同理想状态，这样便于排除因其他因素的存在而影响、干扰实验结果的可能，要探究的实验因素应是变量，因此这个实验中的种子必须是同一种植物的种子．
故答案为：
（1）2号．
（2）一定的水分；充足的空气；
（3）种子结构不完整、胚死亡或正处于休眠期．
（4）是