解题思路：根据微粒的性质回答，微粒都很小，在不断运动；理解分子的定义；化学反应的实质是分子先分成原子，原子再重新组成新的分子，所以原子是化学变化中的最小粒子，构成物质的基本粒子有分子、原子和离子．
A、分子、原子都在不断的运动，正确；
B、原子是化学变化中的最小粒子，正确；
C、有的物质是由分子构成的，有的物质是由原子直接构成，例如金属单质、稀有气体，正确；
D、分子在化学反应中分解为原子，原子再重新组合成其它物质的分子，错误．
故选：D．
点评：
本题考点： 分子和原子的区别和联系．
考点点评： 分子是保持物质化学性质的最小粒子，原子是化学变化中的最小粒子，分子、原子都在不断运动都是构成物质的基本粒子．