生物进化的证据很多,其中最直接的证据是化石,化石在地层中的出现顺序,说明了生物是由简单到复杂、由低等到高等、由水生到陆生逐渐进化而来的;比较解剖学和胚胎学也为生物进化论提供了证据.
故答案为:化石;比较解剖学;胚胎学