解题思路：已知D、d和T、t是分别位于两对同源染色体上的两对等位基因，遵循基因的自由组合定律．则自交后代性状分离比是9：3：3：1；测交后代性状分离比是1：1：1：．1，以此分析答题．
A、已知D、d和T、t是分别位于两对同源染色体上的两对等位基因，遵循基因的自由组合定律．DDTT和ddtt杂交，F1基因型是DdTt，DdTt自交F2中具有双显性性状的个体占[9/16]，其中且能稳定遗传的个体基因型是DDTT，其比例是[1/16]，所以F2双显性性状中能稳定遗传的个体占[1/9]，A错误；
B、后代的表现型数量比为1：1：1：1，则两个亲本的基因型可能为DdTt和ddtt，也可能为Ddtt和ddTt，B错误．
C、若将基因型为DDtt的桃树枝条嫁接到基因型为ddTT的植株上，自花传粉后，果实的基因型是由母本决定的，所以所结果实的基因型是DDtt，C错误；
D、正常情况下，基因型DdTt的个体可产生DT、Dt、dt、dT四种类型的配子，若配子中出现tt类型，可能是在配子形成过程中含两个t基因的染色体未分开而形成，这是染色体不正常分离的结果，导致染色体数目变异，D正确．
故选：D．
点评：
本题考点： 基因的自由组合规律的实质及应用．
考点点评： 本题考查基因的自由组合定律的实质及应用、染色体数目变异等相关知识点，意在考查学生对所学知识的理解与掌握程度，培养学生判断基因型和表现型的能力以及后代情况预测能力．