C是有机质的骨架结构,可以说有机质必然和碳挂上钩,但实际上在土壤有机质测定过程未必只有含碳化合物才会消耗氧化剂,因此只是粗略表征,特别是土壤有机质种类众多,包括腐殖质、微生物、动植物分泌物、酶等等,因此有机质的概念稍微显得有些笼统,有机质的分子量也是不好衡量的,我们在国标测定方法中用的是先测定有机碳的耗氧量,然后乘以一个经验常数,也就是土壤中C和有机质含量的经验常数（沙浴重铬酸钾法）,得出的结论.从上面的论述中你也可以看出,不是不能用,而是有一定区别.
而土壤有机碳相对来说相对准确一些（个人意见）,可以通过高温吹脱测定里面CO2的含量进而推断有机质的含量,但是误差还是有一些的,例如一些碳酸盐化合物的分解,所以温控很重要.