解题思路：生态农业是一个农业生态经济复合系统，将农业生态系统同农业经济系统综合统一起来，以取得最大的生态经济整体效益．它也是农、林、牧、副、渔各业综合起来的大农业，又是农业生产、加工、销售综合起来，适应市场经济发展的现代农业．生态工程的基本原理有物质循环再生原理、物种多样性原理、协调与平衡原理、整体性原理和系统学和工程学原理．建立该人工生态系统的目的是实现对能量的多级利用，提高能量的利用率，减少环境污染．
A、建立生态农业时巧设、增设食物链，可以努力实现物质和能量的分层多级利用，A错误；
B、能量不能循环．建立生态农业时巧设、增设食物链，可以实现能量的多级利用，使废物资源化，B正确；
C、建立生态农业时巧设、增设食物链，可以加强生物防治，控制有害生物的危害，C错误；
D、建立生态农业时巧设、增设食物链，可以减轻对环境的污染、提高抵抗力稳定性，D错误．
故选：B．
点评：
本题考点： 生态农业工程．
考点点评： 本题考查生态农业，意在考查考生识记所列知识点，并能运用所学知识做出合理的判断或得出正确的结论的能力．