解题思路：变异包括可遗传变异和不可遗传变异，前者是由于遗传物质改变引起的，后者是环境因素引起的．可遗传的变异包括：
（1）基因突变是基因结构的改变，包括碱基对的增添、缺失或替换．
（2）基因重组是指同源染色体上非姐妹单体之间的交叉互换和非同源染色体上非等位基因之间的自由组合．
（3）染色体变异是指染色体结构和数目的改变．染色体结构的变异主要有缺失、重复、倒位、易位四种类型．染色体数目变异可以分为两类：一类是细胞内个别染色体的增加或减少，另一类是细胞内染色体数目以染色体组的形式成倍地增加或减少．
①发生于体细胞中的突变（基因突变和染色体变异）以及三倍体西瓜的无子性状（染色体变异）都是可以遗传的变异，①正确；
②镰刀型细胞贫血症的直接原因是正常血红蛋白分子中有一个氨基酸发生改变，根本原因是基因突变，②正确；
③基因重组会引起DNA碱基序列的改变，③错误；
④对于有性生殖的生物，后代具有多样性的主要原因是基因重组，因此某些家庭兄弟姐妹性状不尽相同主要是由于基因重组导致，④正确；
⑤花药离体培养过程中，细胞通过有丝分裂方式增殖，有丝分裂过程中可能会发生基因突变和染色体变异，但不会发生基因重组，⑤错误；
⑥自然选择决定了生物进化的方向，并通过生存斗争来实现，导致基因频率发生定向改变，⑥正确．
故选：C．
点评：
本题考点： 基因突变的特征；基因重组及其意义；染色体结构变异和数目变异．
考点点评： 本题考查生物变异的相关知识，要求考生识记可遗传变异的类型，掌握可遗传变异在育种的应用；识记现代生物进化理论的主要内容，能结合所学的知识准确判断各选项．