解题思路：生物进化的证据有化石证据、比较解剖学上的证据、胚胎学上的证据等，化石是指保存在岩层中的古生物遗物和生活遗迹；比较解剖学是对各类脊椎动物的器官和系统进行解剖和比较研究的科学，比较解剖学为生物进化论提供的最重要的证据是同源器官；胚胎学是研究动植物的胚胎形成和发育过程的科学，也为生物进化论提供了很重要的证据
研究发现，不同的地层中埋藏着不同类型的生物化石：埋藏于较浅地层中的化石与现代生物结构比较相似，埋藏于较深地层中的化石与现代生物结构差别较大，形成早的古老的地形成化石的生物种类少，越简单、低等、水生生物较多．形成晚的地层中，形成化石的生物种类多，越复杂、高等、陆生生物较多，化石在地层中出现的先后顺序，说明了生物的进化历程和进化趋势：由简单到复杂、由低等到高等、由水生到陆生逐渐进化而来的，因此化石是研究进化的主要证据．
故选：A
点评：
本题考点： 生物进化的证据-化石．
考点点评： 理解生命的起源和生物的进化是解答此类题目的关键，要重点掌握．