解题思路：染色体变异包括染色体片段的缺失、重复、易位和倒位，结果会使染色体上基因数目、排列顺序发生变化；基因突变和基因重组不会改变基因的数目和排列顺序．
A、该染色体缺失b片段，属于染色体结构变异，A错误；
B、该染色体和非同源染色体之间发生了交叉互换，属于染色体结构变异中的易位，B错误；
C、该染色体上的片段发生了颠倒，属于染色体结构变异中的倒位，C错误；
D、该染色体上的基因由b变成了B，可能发生了基因突变或四分体时期同源染色体的非姐妹染色单体之间发生了交叉互换，不属于染色体结构变异，D正确．
故选：D．
点评：
本题考点： 染色体结构变异的基本类型．
考点点评： 对于染色体结构变异的四种类型的理解和辨析是本题考查的重点．