解题思路：DNA重组技术至少需要三种工具：限制性核酸内切酶（限制酶）、DNA连接酶、运载体．常用的运载体：质粒、噬菌体的衍生物、动植物病毒，作为运载体的必备条件之一是要有标记基因．标记基因的作用是为了鉴定受体细胞中是否含有目的基因，从而将含有目的基因的细胞筛选出来．常用的标记基因可以是抗生素抗性基因或荧光标记基因．
A、在基因工程，通常使用同一种限制酶切割目的基因和运载体，使它们产生相同的黏性末端，以便形成重组质粒，A错误；
B、运载体是基因工程的工具，不是工具酶，B错误；
C、可用含抗生素的培养基检测大肠杆菌中是否导入了重组质粒，C正确；
D、质粒不是细胞器，是广泛存在于细菌细胞质中的环状DNA分子，D错误．
故选：C．
点评：
本题考点： 基因工程的原理及技术．
考点点评： 本题意在考查考生的识记能力和理解所学知识要点，把握知识间内在联系，形成知识网络结构的能力；能运用所学知识，准确判断问题的能力．获取目的基因和切割载体时使用同种限制酶，目的是产生相同的黏性末端．获取一个目的基因需限制酶剪切两次，共产生4个黏性末端或平末端．限制酶切割位点的选择必须保证标记基因的完整性，以便于检测．