解题思路：单质是由同种元素组成的纯净物，混合物是由多种物质组成的，纯净物是由一种物质组成的，化合物是由两种或两种以上的元素组成的纯净物．
A、单质是由同种元素组成的，可以由原子构成，也可以由分子构成，如氧气是由氧分子构成的，A错
B、混合物是由多种物质组成的，可能是多种化合物组成，也可能是多种单质构成，也可能是由单质和化合物混合而成，如氢气与二氧化碳的混合物．故B错
C、纯净物可以由同种分子构成，也可以由同种原子构成，如铁是由铁原子构成．故C错
D、化合物是由两种或两种以上的元素组成的纯净物．因此化合物中一定含有不同种元素．故D正确．
故选D
点评：
本题考点： 纯净物和混合物的判别；单质和化合物的判别．
考点点评： 明确单质、化合物、纯净物、混合物的概念是解决本题的关健．