解题思路：因甲中只有长翅，倘若乙管为作为亲本，长翅果蝇基因型只能是VV，而残翅果蝇基因型只能是vv．且长翅果蝇、残翅果蝇只能是一种性别．子一代长翅果蝇雌雄个体自交，子二代既有长翅雌果蝇，又有长翅雄果蝇，雌雄各占50%．其中，长翅果蝇的基因型可能是VV或Vv；子二代既有残翅雌果蝇，又有残翅雄果蝇，雌雄各占50%．子二代残翅果蝇基因型为vv．
（1）由题意可知甲中只有长翅，乙中有长翅和残翅，如果乙是亲代，则乙中长翅应是显性纯合子，是VV，残翅应是vv，甲中长翅的杂合子Vv．
（2）若乙管为F2，其乙管中长翅果蝇的基因型为VV和Vv，残翅果蝇的基因型为vv．甲管（F1）中长翅果蝇的基因型为Vv．
（3）通过鉴别雌雄性别得知，乙管内两种果蝇均有雌雄个体，则乙管果蝇是甲管果蝇的子代（F2）．如果乙管内两种果蝇各为雌雄一方，则乙管果蝇是甲管果蝇的亲代（P）．．
（4）若用一次交配实验来鉴别两者的世代关系，其最佳交配方式是乙管中长翅果蝇与残翅果蝇交配．判断的依据是若后代全部为长翅，则乙管中果蝇为亲代（P）；若后代出现性状分离，则甲管中果蝇为子一代（F1），乙管中果蝇为子二代（F2）．
故答案为：（1）VV vv Vv．
（2）VV、Vv vv Vv．
（3）后代 亲本．
（4）让乙管中长翅果蝇和残翅果蝇交配 若后代全部为长翅，则乙是甲的亲代，若出现性状分离，则甲是乙的亲代．
点评：
本题考点： 基因的分离规律的实质及应用．
考点点评： 本题以果蝇为例考查了分离定律的实质及应用，要求考生掌握基因分离定律的知识，能根据题中信息准确判断这对相对性状的显隐性关系及亲本的基因型，再结合所学的知识答题，属于考纲理解层次的考查．