在已知结构的情况下,Rosetta程序可以计算突变体蛋白对于WT蛋白在折叠后的自由能变之差（delta delta G）,可以表明蛋白的稳定性是增加还是降低.还可以通过蛋白在溶液中的分子模拟方法,得到模拟轨迹,在通过mmpbsa/mmgbsa方法计算delta delta G,可以预测蛋白蛋白或者蛋白配体相互作用强度的变化.
如果没有结构,网上有一些根据氨基酸序列预测蛋白稳定性的server.
如何预测蛋白质上单个或几个氨基酸突变对蛋白质整体构像或性质的影响?
在已知结构的情况下,Rosetta程序可以计算突变体蛋白对于WT蛋白在折叠后的自由能变之差（delta delta G）,可以表明蛋白的稳定性是增加还是降低.还可以通过蛋白在溶液中的分子模拟方法,得到模拟轨迹,在通过mmpbsa/mmgbsa方法计算delta delta G,可以预测蛋白蛋白或者蛋白配体相互作用强度的变化.
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