解题思路：根据题意分析可知：白色盘状南瓜与黄色球状南瓜杂交，F1全是白色盘状南瓜，说明白色和盘状为显性性状，且亲本均为纯合子（AABB×aabb），F1为双杂合子（AaBb）．F1自交，F2杂合的白色球状南瓜的基因型为Aabb．
F1白色盘状南瓜自交，F2的表现型及比例为白色盘状（A_B_）：白色球状（A_bb）：黄色盘状（aaB_）：黄色球状（aabb）=9：3：3：1，其中杂合的白色球状南瓜（Aabb）占[2/16]，共有3966株．而纯合的黄色盘状南瓜（aaBB）占[1/16]，所以有3966÷2=1983株．
故选：C．
点评：
本题考点： 基因的自由组合规律的实质及应用．
考点点评： 本题考查基因自由组合定律的相关知识，意在考查学生的识记能力和判断能力，运用所学知识综合分析问题的能力和计算能力．