A、航天飞机在在轨道Ⅱ上由A运动到B，万有引力做正功，动能增大，所以A点的速度小于经过B点的速度．故A错误．
B、轨道Ⅱ上经过A点的所受的万有引力小于经过B点的万有引力，所以在轨道Ⅱ上经过A点的加速度小于经过B点的加速度．故B正确．
C、从轨道I上的A点进入轨道Ⅱ，需要减速，使得在该点万有引力大于所需的向心力做近心运动．所以在轨道Ⅱ上经过A点的速度小于在轨道I上经过A点的速度．故C错误．
D、在轨道Ⅱ上经过A点时所受的万有引力等于在轨道I上经过A点时所受的万有引力，所以加速度大小相等．故D错误．
故选B．