解题思路：本实验中甲基绿使DNA呈现绿色，绿色出现的部位即是DNA在细胞主要分布的部位；两种染色剂对二者的亲和力并不相同．
A、真核细胞中DNA主要分布在细胞核中，RNA主要分布在细胞质中，故A错误；
B、DNA主要存在于细胞核内，在细胞核内DNA与蛋白质结合形成染色质，RNA主要分布于细胞质内，除了RNA外细胞质中还含有多中细胞器等物质，故B错误；
C、甲基绿对DNA的亲和力比对RNA的高，吡罗红对RNA的亲和力比对DNA的高，正因如此两种染色剂才能分别使二者呈现不同颜色，故C错误；
D、细胞核呈现绿色，细胞质呈现红色，这一结果反映了DNA和RNA在细胞中的分布状态，故D正确；
故选：D．
点评：
本题考点： DNA、RNA在细胞中的分布实验．
考点点评： 此题考查了DNA与RNA的分布及两种染色剂的区别和使用方法，针对性强．