A、氢气是由氢分子构成,所以保持氢气化学性质的最小微粒是氢分子,故A正确;
B、水分子是保持水化学性质的最小微粒,故B错;
C、氢气中不存在氢离子,故C错;
D、2H表示两个氢原子,保持氢气化学性质的最小微粒是氢分子,故D错.
故选A.