A、由晶胞结构可知，每个Zn原子周围有4个S原子，每个S原子周围有4个Zn原子，立方ZnS中Zn原子面心立方堆积，S原子为体心立方堆积，六方ZnS中原子为六方最密堆积，故A正确；
B、由晶胞结构可知，立方ZnS中S原子作体心立方最密堆积，在六方ZnS晶体中，S原子作六方最密堆积，故B正确；
C、由立方ZnS晶胞可知，Zn原子填充在一半的四面体空隙中，Zn原子面心立方堆积，形成立方面心点阵，故C错误；
D、立方ZnS和六方ZnS属于晶体结构不同，不是分子结构不同，二者不是同分异构体，故D正确；
故选C．