如图,过点O作OM⊥BC于M,作ON⊥CD于N,
∵O点是正方形ABCD对角线的交点,
∴OM=ON,且∠MON=90°,
∵四边形OEFG是正方形,
∴∠EOG=∠KOM+∠MOH=90°,
又∵∠MON=∠HON+∠MON=90°,
∴∠KOM=∠HON,
在△KOM和△HON中,
∠OMK=∠NOH=90°
OM=ON
∠KOM=∠HON ,
∴△KOM≌△HON(ASA),
∴S △KOM=S △HON,
∵点O是正方形ABCD对角线的交点,边长为a,
∴阴影部分的面积=
1
4 S 正方形ABCD=
1
4 a 2.
故选C.