解题思路：此题是一个综合性的填空题，涉及生物进化的总体趋势、进化的证据、自然选择等内容，结合生物进化树来分析解答．
（1）、分析图形可知，动物的进化历程是：无脊椎动物→脊椎动物（古代的鱼类→古代的两栖类→古代的爬行类→古代的鸟类和哺乳类），可见动物进化的总体趋势是：由简单到复杂、由低等到高等、由水生到陆生．
（2）、在研究生物进化的过程中化石是最有力的证据，化石是指生物的遗体、遗物或生活痕迹，由于某种原因被埋藏在地层当中，经过复杂的变化形成的．通过研究始祖鸟的化石发现，始祖鸟既有像鸟类的地方，也具有爬行动物的特征，可见始祖鸟是鸟类与爬行类之间的过渡类型，原始鸟类是由原始爬行动物进化来的．
（3）、化石是研究生物进化过程中最直接、最有力的证据，化石证明有许多物种只存活了相当短暂的时代就逐渐灭绝了，说明形成化石的生物不适用当时的环境，缺乏能适应环境变化的可遗传变异，因此被自然界淘汰掉．故选：A
（4）、达尔文认为生物是进化的，适者生存，不适者被淘汰，如生活在绿草地的青蛙，背部多是绿色的而不是褐色的，绿色的青蛙与环境的颜色相似，不易被天敌发现，生存的机会增大，更适应环境．
故答案为：（1）简单到复杂；低等到高等；水生到陆生
（2）始祖鸟；遗体、遗物或生活痕迹
（3）A
（4）D
点评：
本题考点： 生物进化的历程．
考点点评： 此题的涉及的知识面比较广，我们要熟练掌握相关的基础知识，结合题意，灵活解答本题．