解题思路：由整数的整除性，可得A、B都表示奇数集，C表示除以4余1的整数且D表示除以4余3的整数．由此利用集合的交集、并集的定义，不难得到本题的答案．
∵集合A={x|x=2k+1，k∈z}，B={x|x=2k-1，k∈z}，
∴A、B都表示奇数集，可得A=B，且A∩B≠φ，得①正确且③不正确
而C={x|x=4k+1，k∈z}，表示除以4余1的整数；D={x|x=4k-1，k∈z}，表示除以4余3的整数
∴C≠D，且C∩D=∅，得②不正确且④正确；
∵一个奇数除以4之后，余数不是1就是3，
∴C∪D=A、C∪D=B，可得⑤正确
综上所述，可得真命题是①④⑤，共3个
故选：B
点评：
本题考点： 命题的真假判断与应用．
考点点评： 本题给出关于集合运算的几个命题，求其中真命题的个数．着重考查了整数的整除性和集合的基本运算的知识，属于中档题．