解题思路：此题考查的知识点是植物细胞的结构功能和植物体的结构层次．
A、不是所有的植物细胞都有叶绿体，只有植物细胞细胞质的绿色部分含有叶绿体．如洋葱表皮细胞没有叶绿体．该选项正确．B、植物体的结构层次由小到大依次是细胞→组织→器官→植物体．西瓜在结构层次上属于果实．因此，该选项的叙述是不正确的．C、细胞分化的结果形成各种组织．该选项正确．D、保护组织一般由植物根、茎、叶、果实表面的表皮细胞构成，具有保护内部柔嫩部分的功能．因此，表皮破损的番茄很快腐烂．该选项正确．故选：B．
点评：
本题考点： 绿色开花植物体的结构层次．
考点点评： 解此题的关键是理解掌握植物细胞的结构功能和植物体的结构层次．