不知道你要克隆什么基因的启动子?
一般而言,如果是与模式生物亲缘关系较近的生物中克隆某基因的启动子,可以查询模式生物该基因的sequence viewer相关信息,这个在拟南芥数据库以及NCBI中都可以实现.相关操作内容可以参阅本论坛中关于NCBI使用方法的一些帖子.
查到sequence viewer后,选取该基因5‘UTR上游2000bp的序列作为你的目的序列,然后与你的基因的已知序列（我想,在克隆启动子之前,你应该至少已经有你的目的基因的CDS了吧?）ATG下游序列进行拼接,然后利用你查到的序列设计F引物,利用你已知的目的基因序列设计R引物,再按照常规PCR进行后续试验即可!
对于那些与模式生物亲缘关系较远的生物而言,我建议你在CNKI上输入“启动子克隆”为关键词查一下,你会发现,应该有很多人总结过这方面的技术的!
另外,我这还有几种方法,需要M我