解题思路：A、根据丙氨酸的微观构成进行分析判断．
B、根据丙氨酸的微观构成进行分析判断．
C、根据分子是由原子构成的，进行分析判断．
D、由不同种元素组成的纯净物是化合物．
A、丙氨酸是由丙氨酸分子构成的，1个丙氨酸分子是由四种原子构成的，故选项说法错误．
B、丙氨酸是由丙氨酸分子构成的，不含氧分子，故选项说法错误．
C、分子是由原子构成的，丙氨酸分子由碳、氢、氧、氮四种原子构成的，故选项说法错误．
D、丙氨酸是由碳、氢、氧、氮四种元素组成的纯净物，属于化合物，故选项说法正确．
故选：D．
点评：
本题考点： 化学式的书写及意义；单质和化合物的判别．
考点点评： 本题难度不大，考查同学们结合新信息、灵活运用化学式的含义等进行分析问题、解决问题的能力．