解题思路：根据两点之间线段最短，对顶角的定义，线段中点的定义，垂线的性质，平行线的定义对各小题分析判断即可得解．
①两点之间的所有连线中，线段最短，正确；
②相等的角是对顶角，错误；
③若AC=BC，则点C是线段AB的中点，错误，A、B、C不一定共线；
④长方体是四棱柱，正确；
⑤不相交的两条直线叫做平行线，错误，应强调在同一平面内；
⑥过一点有且只有一条直线与已知直线垂直，错误，应强调在同一平面内；
综上所述，正确的是①④．
故选B．
点评：
本题考点： 线段的性质：两点之间线段最短；认识立体图形；两点间的距离；对顶角、邻补角；垂线；平行线．
考点点评： 本题考查了两点之间线段最短，对顶角的定义，垂线的性质，平行线的定义，是基础题，熟记相关概念与性质是解题的关键．