解题思路：细菌的结构包括细胞壁、细胞膜、细胞质、未成形的细胞核；
真菌的结构包括细胞壁、细胞膜、细胞质和细胞核．
植物的细胞结构包括细胞壁、细胞膜、细胞质、细胞核、叶绿体和液泡；
动物（人）细胞有细胞膜、细胞质和细胞核．
由分析可知，真菌和植物细胞最相似，都有细胞壁、细胞膜、细胞质、细胞核，不同的是真菌没有叶绿体．
A、变形虫、属于动物，水绵属于植物，香菇属于真菌，三种的共同特点是，都有细胞膜、细胞质和细胞核．A错误；
B、衣藻和豌豆属于植物，灵芝属于真菌，三种共同特点是都有细胞壁、细胞膜、细胞质、细胞核．B正确；
C、小麦和番茄属于植物，乳酸菌属于细菌，三者细胞都有细胞壁、细胞膜、细胞质．C错误；
D、大肠杆菌属于细菌、酵母菌和霉菌属于真菌，共同特征是都有细胞壁、细胞膜、细胞质．D错误．
故选：B
点评：
本题考点： 生物的分类及分类单位．
考点点评： 回答此题的关键是明确各生物的细胞结构．