解题思路：本题主要考查基因、DNA和染色体三者之间的相互关系．
基因是有遗传效应的DNA片段，是决定生物性状的遗传物质的结构和功能单位．染色体的主要成分是DNA和蛋白质．染色体是DNA的主要载体，每个染色体上有一个或两个DNA分子，基因在染色体上呈线性排列．每个DNA分子含多个基因．每个基因中含有许多脱氧核苷酸．遗传信息是指基因中脱氧核苷酸的排列顺序．
（1）基因和染色体行为存在着明显的平行关系．
（2）摩尔根是第一位绘出果蝇的基因在染色体上位置图的学者．
（3）染色体的主要成分是DNA和蛋白质．
（4）因为等位基因应位于一对同源染色体的同一位置上，而图中朱红眼基因和深红眼基因位于同一染色体上，所以图中染色体上的朱红眼基因和深红眼基因不是一对等位基因．
故答案为：
（1）平行
（2）摩尔根
（3）DNA 蛋白质
（4）不是 等位基因应位于一对同源染色体的同一位置上，而图中朱红眼基因和深红眼基因位于同一染色体上
点评：
本题考点： 基因与DNA的关系；细胞核的结构和功能．
考点点评： 本题主要考查学生对知识的理解和分析能力．要注意，基因和染色体行为存在着明显的平行关系主要表现在：1、基因在杂交过程中保持完整性和独立性，染色体在配子形成和受精过程中也有相对稳定的稳定性．2、在体细胞中基因成对存在，染色体在也是成对的，在配子中只有成对基因中的一个，同样，成对的染色体也只有一条．3、体细胞中成对的基因一个来自父方，一个来自母方，同源染色体也是．4、非同源染色体在减数第一次分裂后期是自由组合的．非同源染色体上的非等位基因在形成配子时自由组合．