基因重组是所有生物都可能发生的基本的遗传现象.无论在高等生物体内,还是在细菌、病毒中,都存在基因重组.不仅在减数分裂过程中会发生基因重组,在高等生物的体细胞中也会发生基因重组.基因重组不仅可以发生在细胞核内的基因之间,也可以发生在线粒体和叶绿体的基因之间.可以说,只要有DNA,就可能发生重组.
从广义上讲,任何造成基因型变化的基因交流过程,都叫做基因重组.而狭义的基因重组仅指涉及DNA分子内断裂—复合的基因交流.真核生物在减数分裂时,通过非同源染色体的自由组合形成各种不同的配子,雌雄配子结合产生基因型各不相同的后代,这种重组过程虽然也导致基因型的变化,但是由于它不涉及DNA分子内的断裂c复合,因此,不包括在狭义的基因重组的范围之内.
根据重组的机制和对蛋白质因子的要求不同,可以将狭义的基因重组分为三种类型,即同源重组、位点特异性重组和异常重组.同源重组的发生依赖于大范围的DNA同源序列的联会,在重组过程中,两条染色体或DNA分子相互交换对等的部分.真核生物的非姊妹染色单体的交换、细菌以及某些低等真核生物的转化、细菌的转导接合、噬菌体的重组等都属于这种类型.大肠杆菌的同源重组需要RecA蛋白,类似的蛋白质也存在于其他细菌中.位点特异性重组发生在两个DNA分子的特异位点上.它的发生依赖于小范围的DNA同源序列的联会,重组也只限于这个小范围.两个DNA分子并不交换对等的部分,有时是一个DNA分子整合到另一个DNA分子中.这种重组不需要RecA蛋白的参与.异常重组发生在顺序不相同的DNA分子间,在形成重组分子时往往依赖于DNA的复制而完成重组过程.例如,在转座过程中,转座因子从染色体的一个区段转移到另一个区段,或从一条染色体转移到另一条染色体.这种类型的重组也不需要RecA蛋白的参与.