解题思路：阅读题干可知，本题的知识点是基因自由组合规律，梳理相关知识点，根据问题提示结合基础知识进行回答．
根据题意分析可知：三对等位基因位于两对同源染色体上时，有两对基因位于一对同源染色体上，另一对基因位于另一对同源染色体上．位于一对同源染色体上这两对基因在减数分裂时不能自由组合，但可和位于另一对同源染色体上的基因自由组合，但四分体时期可能存在交叉互换，所以后代的基因型最多能有3×3×3=27种．
故选：C．
点评：
本题考点： 基因的自由组合规律的实质及应用．
考点点评： 本题考查基因自由组合规律的相关知识，意在考查学生的识记能力和判断能力，运用所学知识综合分析问题和解决问题的能力．