解题思路：镁元素是合成叶绿素的原料，雾霾天气长期影响植物对镁等矿质元素的吸收，引起植物的叶片逐渐变黄．光反应阶段需要光照才可以进行，如果雾霾中的污染颗粒导致光照强度下降，影响了光合作用的光反应阶段．CO2是进行暗反应的原料，污染颗粒堵塞了气孔使CO2的吸收减少，影响了光合作用的暗反应阶段．
（1）光反应阶段需要光照才可以进行，如果雾霾中的污染颗粒导致光照强度下降，影响了光合作用的光反应阶段．CO2是进行暗反应的原料，污染颗粒堵塞了气孔使CO2的吸收减少，影响了光合作用的暗反应阶段．
（2）对照如下装置可以发现：装置内空气种类（空气中是否有雾霾颗粒）不同，可判断为该实验的自变量．在其他环境条件相同的条件下，若雾霾只影响光反应阶段，C3含量上升；若只影响暗反应阶段，C3含量下降，因此测量叶肉细胞中三碳化合物（C3）的含量作为检测指标．若雾霾对光反应和暗反应均有影响，两组三碳化合物含量无显著差异．
（3）镁元素是合成叶绿素的原料，在长期观察中发现，雾霾天气影响植物对镁等矿质元素的吸收，引起植物的叶片逐渐变黄．
故答案为：
（1）光反应 暗反应
（2）装置内空气种类（空气中是否有雾霾颗粒） 若雾霾只影响光反应阶段，C3含量上升；若只影响暗反应阶段，C3含量下降 雾霾对光反应和暗反应均有影响
（3）Mg
点评：
本题考点： 光反应、暗反应过程的能量变化和物质变化；细胞呼吸的过程和意义．
考点点评： 本题着重考查了光合作用、呼吸作用过程中的物质变化和能量变化等方面的知识，意在考查考生能识记并理解所学知识的要点，把握知识间的内在联系，形成一定知识网络的能力，并且具有一定的分析能力和理解能力．