解题思路：探究“细胞大小与物质运输的关系”的实验的目的是通过探究细胞表面积与体积之比，与物质运输速率之间的关系，探讨细胞不能无限长大的原因；实验中测量不同大小的琼脂块上NaOH扩散的深度相同；通过模拟实验可看出，细胞体积越小，其相对表面积越大，细胞的物质运输效率就越高；实验所用的琼脂小块上含有酚酞，NaOH和酚酞相遇，呈紫红色．
A、实验中测量不同大小的琼脂块上NaOH扩散的深度相同，即NaOH扩散的速率是一致的，A正确；
B、通过模拟实验可看出，细胞体积越小，其相对表面积越大，琼脂块的表面积与体积之比随琼脂块的增大而减小，B错误；
C、由于受细胞核内DNA的制约细胞体积不能无限增大，C正确；
D、通过模拟实验可看出，细胞体积越小，其相对表面积越大，细胞的物质运输效率就越高，D正确．
故选：B．
点评：
本题考点： 探究细胞表面积与体积的关系．
考点点评： 本题考查细胞大小与物质运输关系的相关知识，意在考查学生理解所学知识的要点和综合运用所学知识分析问题的能力，具备设计简单生物学实验的能力，并能对实验现象和结果进行解释、分析的能力．