你的推理是不错的,但不全面.
首先,自然选择的前提条件不仅只是繁殖,还有一个更重要的前提条件是生存.你从繁殖追踪到了基因,可若单从生存又能本质性地追踪到基因吗?你可以说“繁殖的本质就是基因的延续”,但你可以说“生存的本质就是基因的保持（或类似的别的什么）”吗?
其次,既然追踪到了基因,何不进一步追踪到DNA重组、碱基对之间的氢键断裂等等呢?于是,按你的推理,我所支持的“自然选择作用于个体”就相当于默认了“自然选择作用于DNA”的正确性,也相当于默认了“自然选择作用于碱基对”的正确性,等等,这似乎都没错啊!为何你要止步于基因,而不进一步往生物高分子追踪呢?既然你可以止步于基因,我为何不可以止步于个体呢?
再次,其实我早已说过,“广义来说,自然选择作用的对象可以说是从生物大分子直到整个生物界这样广大的范围,但它作用的最直接的对象我认为是个体.”亦即,我的观点其实不是“自然选择作用于个体”,而是“自然选择作用的最直接的对象是个体”.