1.蛋白质的分
蛋白质分子在细菌分泌的蛋白质水解酶的作用下,在肽键处断裂,生成多肽和二肽.多肽和二肽在肽酶的作用下水解,生成各种氨基酸.二肽和氨基酸可被细菌吸收,氨基酸在体内脱氨基酶的作用下,经脱氨基作用生成氨.不同种细菌在不同的条件下所进行的脱氨基作用的方式（氧化脱氨基、水解脱氨基、还原脱氨基）及代谢产物也不同.可借此鉴别细菌.如有些细菌能使色氨酸氧化脱氨基,生成吲哚、C02和H20.细菌还可以用脱羧酶使氨基酸脱羧,生成胺类（如组胺）和C02.
2.糖类的分
细菌分泌胞外酶,将菌体外的多糖分解成单糖（葡萄糖）后再吸收.各种细菌将多糖分解为单糖,进而转化为丙酮酸,这一过程是一致的.丙酮酸的利用,需氧菌和厌氧菌则不相同.需氧菌将丙酮酸经三羧酸循环彻底分解成CO2和水.厌氧菌则发酵丙酮酸,产生各种酸类（如甲酸、乙酸、丙酸、丁酸、乳酸、琥珀酸等）、醛类（如乙醛）、醇类（如乙醇、乙酸甲基甲醇、异丙醇、丁醇等）、酮类（如丙酮）.不同细菌具有不同的酶,对糖类的分解能力和代谢产物也不同,借此可以鉴别细菌.
3.细菌对其他物质的分
细菌除能分解糖和蛋白质外,对一些有机物和无机物也可分解利用.各种细菌产生的酶不同,其代谢的基质不同,代谢的产物也不一样,故可用于鉴别细菌医学|教育网搜集整理.
（1）对其他有机物的分如变形杆菌具有尿素酶,可以水解尿素,产生氨.乙型副伤寒沙门菌和变形杆菌都具有脱硫氢基作用,使含硫氨基酸（胱氨酸）分解成氨和H2S.
（2）对其他无机物的分产气肠杆菌分解柠檬酸盐生成碳酸盐,并分解培养基中的铵盐生成氨.细菌还原硝酸盐为亚硝酸盐,氨和氮气的作用,称为硝酸盐还原作用.