A、没有480mL的容量瓶，实际应配制500mL溶液，需要硫酸铜晶体的质量为0.5L×0.1mol/L×250g/mol=12.5g，故A错误；
B、浓硫酸溶解放出大量的热，不冷却立即转移定容，溶液冷却后所配溶液的体积偏小，所配溶液的浓度偏高，应冷却至室温后再转移溶液，故B错误；
C、称量5.3g碳酸钠固体时，若将物质和砝码放反，实际称量的碳酸钠的质量为5g-0.3g=4.7g，故C正确；
D、溶液高于刻度线，所配溶液的体积偏大，溶液的浓度偏小，溶液是均匀的，即使吸出多余的溶液，剩余溶液浓度等于原溶液的浓度，应重新配制，故D错误；
故选C．