解题思路：A、许多离子和分子在水中是无色澄清透明的；
B、天然雨水溶解了二氧化碳气体等物质；
C、水因煮过久，水中不挥发性物质，如钙、镁等重金属成分和亚硝酸盐含量很高；
D、蒸馏水是通过蒸馏操作得到的纯净的水．
A、化学上纯净的水是指只含有水分子，许多离子和分子在水中是无色澄清透明的，例如食盐水、蔗糖溶液，故A错误；
B、天然雨水溶解了二氧化碳气体等物质，因此天然雨水属于混合物，故B错误；
C、水因煮过久，水中不挥发性物质，如钙、镁等重金属成分和亚硝酸盐含量很高，因此不能喝反复煮沸的水，故C错误；
D、蒸馏水是通过蒸馏操作得到的纯净的水，不含Ca2+、Mg2+等金属离子，故D正确；
故选：D．
点评：
本题考点： 溶液的组成．
考点点评： 本题考查各种水的成分，对于化学工作者而言，纯净的水就是指只含有水分子的物质．