1.这个问题涉及到了2种时态的用法问题.南希在做作业吗?表示现在正在进行的事情,所以用现在进行时.现在进行时的结构为 be+ V－ing,表示说话的时候正在发生或者正在做的事情.
例句：we are doing our homework now.我们现在在做作业.
He is singing a song.他在唱歌.
Does nancy do her homework?是一般现在时,表示的是经常性、习惯性的行为或者现在所处的状态,这句话的意思是 ：南希做作业吗?就是说她平时有没有做作业.
例句：I go to school every Monday.我每个星期一去学校.表示经常性的习惯性的发生.
He is a teacher.表示状态.
另外一些表示永恒不变的事情也是用一般现在时：
比如：The earth is round.地球是圆的.这是真理,不变的.
2.当句子中存在be动词时,一般疑问句直接把be动词提前；比如你的问题中的第一句,.
如果句中不含有be动词或者情态动词,改为疑问句或者否定句时需要加助动词,do/don't
比如：I like bananas.改为一般疑问句：Do you like bananas?
改为否定句：I don't like bananas.
特殊疑问句：What do you like?
3.上面就说到了什么时候用don't.当句中含有be动词时,它的否定形式直接在be动词后面加not
例如：He is a student.改为否定句：He is not a student.