这里先找出与其它两个不同的-- on the phone 表示通话状态,说明说话人此时正处于通话的状态,在聊电话.
eg：turn down the TV! i am on the phone!
把电视音量关小!我正在打电话!
接下来对比下over和 through 这两个介词的不同.
首先,over phone 和by phone 的大概意思相近：通过电话,用电话 （表示一种手段）
eg：i made a booking by phone/over the phone.
我打电话（使用电话）进行了预定
再次,through the phone也表示,通过电话,但这种通过与之前的不同,through the phone 更侧重于穿过电话,隔着电话.（做某事.谈论某内容）
eg：kiss me through the phone 通过电话吻我/ 隔着电话吻我.
综上所述,推荐选through