A、化石是研究生物进化最重要的、比较全面的证据，化石是由古代生物的遗体、遗物或生活痕迹等，由于某种原因被埋藏在地层中，经过漫长的年代和复杂的变化而形成的．并不是生物的遗体、遗物或生活痕迹就叫化石，研究发现，不同的地层中埋藏着不同类型的生物化石：埋藏于较浅地层中的化石与现代生物结构比较相似，埋藏于较深地层中的化石与现代生物结构差别较大，并且越是古老的地层中发掘的生物化石结构越简单、低等，水生生物的化石越多；越是晚期的地层中发掘的生物化石结构越复杂、高等，陆生生物化石越多．化石在地层中出现的先后顺序，说明了生物的进化历程和进化趋势：由简单到复杂、由低等到高等、由水生到陆生逐渐进化而来的，因此化石是研究进化的主要证据．故不符合题意；
B、1986年我国科学家在辽宁发现的辽西鸟和孔子鸟等化石证明了鸟类起源于古代的爬行类而不是两栖类．故符合题意；
C、1986年我国科学家在辽宁发现的“中华龙鸟”是迄今发现的最早的原始鸟类化石，故不符合题意；
D、绿色开花植物又叫被子植物，主要特征是：胚珠外有子房壁包被，种子有果皮包被；受精过程不需要水，具有双受精现象；有根、茎、叶、花、果实和种子六大器官组成．在地球上的30多万种植物中，被子植物就占20多万种．植物的进化历程是
．所以绿色开花植物是植物界中最高等、数量最多的类群．故不符合题意．
故选B