解题思路：本题是考查DNA分子的结构特点和DNA分子的复制．DNA分子是由两条脱氧核苷酸链组成的规则的双螺旋结构，磷酸与脱氧核糖交替排列分布在外侧构成基本骨架，碱基排列在内侧，通过氢键连接成碱基对排列在内侧碱基对之间的连接遵循碱基互补配对原则，A与T配对，G与C配对．一个DNA分子复制2次生成4个DNA分子．先由题意计算出每个DNA分子中的胞嘧啶脱氧核苷酸数量，然后计算出一个DNA分子复制2次生成4个DNA分子共需要胞嘧啶脱氧核苷酸分子数．
根据目的基因有100个脱氧核苷酸对，而一条单链上碱基A：G：T：C=1：2：3：4，则该链中G为20个，C为40个．所以另一条单链上G为40个，C为20个．因此，目的基因中含碱基C为60个．利用PCR技术进行扩增时，在第4次扩增时，共已形成8个目的基因，因此扩增时需要游离的胞嘧啶脱氧核苷酸的数量为60×8=480个．
故选：B．
点评：
本题考点： DNA分子的复制；DNA分子结构的主要特点．
考点点评： 本题的知识点是根据DNA分子的结构特点和DNA分子的复制结果，根据碱基互补配对原则进行简单的碱基计算．对碱基互补配对原则的理解是解题的关键．