（1）∵某食物营养所想用x千克甲种食物，y千克乙种食物，z千克丙种食物配成100千克混合物，
∴z=100-x-y，
∴P=5x+4y+3z=5x+4y+3（100-x-y）=2x+y+300元；
（2）由题意可得：
300x+500y+300z≥35000
700x+100y+300z≥40000，
又∵z=100-x-y，∴
y≥25
2x−y≥50
∴P=300+2x+y=300+（2x-y）+2y≥400，当且仅当x=37.5，y=25时等号成立，
所以当x=37.5千克，y=25千克，z=37.5千克时成本最低，最低成本为400元．