解题思路：病菌抗药性的产生发生在使用抗菌素之前，使用抗菌素后，抗菌素对病菌进行了选择，抗药性强的个体生存下来，抗药性弱的个体被淘汰掉．
A、抗药能力产生于使用抗菌素之前，且变异是不定向，A错误；
B、抗菌素对病菌进行了选择，非人工选择，B错误；
C、抗菌素对病菌进行了选择，生存下来的病菌都是抗药能力强的，C正确；
D、病菌中原来就有抗药性强的个体和抗药性弱的个体，在使用抗菌素的过程中淘汰了抗药性弱的个体，抗药能力强的个体被选择了下来，D正确．
故选：C D．
点评：
本题考点： 现代生物进化理论的主要内容；基因频率的变化．
考点点评： 本题考查了如何用自然选择学说解释生物进化的现象，解答时注意先是变异产生了进化的原材料，后是自然界选择了适应环境的变异类型．