A、从微观角度来说，如果是由分子构成的物质，那么含有一种分子的是纯净物，含有多种分子的是混合物．如果是由原子构成的物质，那么含有一种原子的是纯净物，含有多种原子的是混合物．④石灰水、⑥海水由不同物质组成属混合物，所以选项不正确．
B、有机物的特征是它由碳元素组成的化合物，②蛋白质、③甲烷属于有机物．所以选项错误．
C、可燃物具有易燃性，甲烷易燃烧生成二氧化碳和水，而其它物质不具有可燃性，所以选项错误．
D、根据单质是由同种元素组成的纯净物，只有液态氧是由同种元素组成的，是纯净物，所以选项正确．
故选D