解题思路：石是证明生物进化的最重要的证据，鸟类是由古代爬行动物的一支进化而来的．最早的鸟类化石，就是世界闻名的始祖鸟化石．
A、化石是由古代生物的遗体、遗物或生活痕迹等，由于某种原因被埋藏在地层中，经过漫长的年代和复杂的变化而形成的．在研究生物进化的过程中，化石是最直接的、比较全面的证据，A正确．
B、始祖鸟的身体结构既和爬行动物有相似之处，又和鸟类有相同之处，根据以上特征，科学家认为始祖鸟是由爬行类进化到鸟类的一个过渡类型，B错误．
C、森林古猿的一支是现代类人猿，以树栖生活为主，另一支却由于环境的改变慢慢的进化成了人类，它们有共同的原始祖先是森林古猿．C正确．
D、生物进化论最早是由达尔文提出的，达尔文在1859年发表了《物种起源》一书，提出了以“自然选择学说”为核心的生物进化理论．D正确．
故选：B
点评：
本题考点： 生物进化的证据-化石．
考点点评： 知道始祖鸟化石的特点是解答此类题目的关键．