目前食用菌生产上常用的鉴定方法有目测和镜检,当然最可靠的方法还是通过生活力测试以及出菇试验.
1、肉眼直接观察法 母种、原种、栽培种,菌丝颜色一致,洁白或灰白,粗壮、浓密.一般无黄水、无原基、无杂菌污染.培养基无失水皱缩,棉塞无杂菌.
2、显微镜观察法 观察内容包括：菌丝是否有分支,分支越多越好；观察细胞质浓度,细胞质颗粒越多,浓度越高,质量越好；菌丝有隔膜,锁状联合明显；测一测菌丝粗度,越粗越好.
3、生活力测试及出菇试验
（1）生活力测试 菌种转接后,若菌丝生长迅速,整齐浓密,健壮有力,则表明为优良菌种.
（2）出菇试验 要选用本地具代表性的栽培料或不同栽培料同时制种栽培,进行品比.此方法最有说服力,只是需时较长.主要观察指标包括：出菇早晚,一般出菇早的好,但并非越早越好;产量高低,子实体形态特征等.