解题思路：分析图解可知，图中①是细胞核，②是线粒体，③是核糖体，④是内质网，⑤是叶绿体，⑥是细胞质基质．
A、分析图解可知，图中②是线粒体，线粒体具有双层膜，并且膜结构的主要成分为磷脂和蛋白质，因此其中的磷元素主要存在于磷脂中，A错误；
B、RNA主要分布在细胞质中，在细胞核中也有少量分布，其中细胞质基质、线粒体和叶绿体中均有RNA，并且核糖体就是由RNA和蛋白质组成的，B正确；
C、④表示内质网，内质网只具有单层膜结构，C错误；
D、线粒体的基质中能够产生ATP（有氧呼吸第二阶段），但是叶绿体的基质中不能产生ATP，D错误．
故选：B．
点评：
本题考点： 原核细胞和真核细胞的形态和结构的异同．
考点点评： 本题知识点难度不大，结合细胞部分结构示意图，考查细胞结构和功能，要求考生识记细胞中各结构的图象，能准确判断图中各结构的名称，尤其是细胞中各种细胞器的结构和功能；同时识记RNA在细胞中的分布．