（1）基因控制生物的性状．“科学家将一种来自发光水母的基因，结合到普通的老鼠的基因中，培育出的老鼠到了夜晚居然能够发出绿色荧光”，由于这些老鼠体内具有了发光水母的部分基因，因此能够发出荧光，这说明生物的性状是由基因控制的．
（2）在一对相对性状的遗传过程中，子代个体中出现了亲代没有的性状，新出现的性状一定是隐性性状．从表中所示遗传结果，亲代都是黑色×黑色，而后代中出现了黄色的个体，说明黄色是隐性性，黑色是显性性状．所以由交配组合①可判断黑色是显性性状．
（3）通常大写字母是显性基因，小写字母是隐性基因．老鼠毛色有黑色和黄色，这是一对相对性状（由一对遗传基因B、b控制）．因此根据上述表中的交配组合可知甲（黄色）的基因组成是bb．
（4）交配组合③甲（黄色）×丁（黑色）产生的子代全为黑色．甲（黄色）的基因组成是bb，遗传给子代的一定是b，因此表明子代黑色的基因组成是Bb．子代（黑色雌雄老鼠）交配，遗传图解如图：
从遗传图解看出交配组合③产生的子代（黑色雌雄老鼠）交配后，产生的后代毛色为黄色的概率是25%．
故答案为：
（1）基因；
（2）①；黑色；
（3）bb；
（4）25%．